
קפריסין היא החברה היחידה באיחוד האירופי שיש לה בסיס מס טונאז' מאושר לצורכי ספנות מסחרית. חוק הספנות המסחרית, N44(I)/2010, אושר בבית הנבחרים ונכנס לתוקף ב-1 בינואר 2010.
זהו גם יתרון מרכזי לקפריסין במפת השיט העולמית, שכן הצליחה למלא תפקיד בולט ומוביל כמרכז שיט וניהול באמצעות חיזוק התשתיות הימיות ומשטר המס הנוח, וכן מסגרת רגולטורית אטרקטיבית ותחרותית מאוד לרישום כלי שיט ולתחזוקת מס הטון.
במקביל, קפריסין ומערכת המס שלה לשיט מעוצבות על פי דרישות האיחוד האירופי, וכן על פי הנחיות ארגון לשיתוף פעולה ופיתוח (OECD) נגד כל פרקטיקת מס מזיקה.
רישום קפריסין הוא כיום אחד הגדולים באיחוד האירופי והעשירי בגודלו בעולם. בנוסף, קפריסין היא מרכז ניהול הספינות השלישי בגודלו באיחוד האירופי.
הצטרפות קפריסין לאיחוד האירופי (EU) בשנת 2004 יצרה הזדמנויות חדשות לפיתוח נוסף במגזר הימי.
רישום הספנות המסחרית של קפריסין הוא אחד משני "הרישומים הפתוחים" באיחוד האירופי ומוערך כמהווה 15% מצי הסוחרים של האיחוד האירופי.
לקפריסין יש תשתית ימית מבוססת הכוללת את בית המשפט הימי, לשכת המסחר הימית וחברת הסיווג.
יש לה גם מחלקה מיוחדת, מחלקת הצי הסוחר, הפועלת במסגרת משרד התקשורת והעבודות ומציעה שירותים בעלי ערך גבוה לתעשיית השייט.
חקיקת המס בקפריסין מציעה פטור מלא ממס על כל הרווחים והדיבידנדים בכל רמות החלוקה הנובעים מפעילויות שיט זכאיות
ב-29 באפריל 2010, אימץ הפרלמנט הקפריסטי את החקיקה הימית החדשה.
החקיקה החדשה על צי סוחר, שנכנסת לתוקף מאז 1 בינואר 2010, הרחיבה משמעותית את תחום משטר מס הטון.
על פי החקיקה החדשה, פעילויות שיט זכאיות פטורות ממס הכנסה. מס טונאז' המבוסס על הטון הנקי של כלי השיט מוטל במקום מס הכנסה תאגידי על רווחים בפועל. חברות עם פעילות זכאית עומדות בכל התחייבותיהן כלפי משרד הצי המסחרי ולא כלפי רשויות המס.
אפשרי, ולעיתים קרובות טבעי, שבעלי ספינות, שוכרים ומנהלי סירות ישקיעו הון עודף ויהיו להם הכנסה מפעילויות שאינן ימיות.
הכנסה זו, שאינה כפופה למס טונאז', אך כפופה למס חברות בשיעור סטנדרטי של 15%, שיעור מס החברות הנמוך ביותר באיחוד האירופי. במקרה שיש הכנסה מעורבבת מפעילות שינוע ופעילות שאינה שינועית (מס טון ומס חברות), יש לשמור ספרים נפרדים.